タイトルの意味わからん。
AWS の ec2 インスタンスに filezilla で SFTP する。
Windows だと WinSCP でやってたやつ。

filezilla を起動して「編集」→「設定」→「SFTP」と進み、鍵ファイル(*.pem)を追加する。
接続先情報は
ホスト→sftp://[ec2インスタンスのIPアドレスかホスト名]
ユーザ名→ec2-user

まぁ別に難しいことはない。